У DokuWiki имеется гибкий API плазинов, который позволяет расширять их функциональность – вводить дополнительные режимы синтаксиса, специальные режимы действий, новые форматы экспорта и многое другое. В зависимости от предназначения плагина, плагин может состоять из одного или более типов плагинов, представленных ниже.

В настоящее время DokuWiki содержит пять разных типов плагинов.

• Плагины синтаксиса расширяют базовый синтаксис DokuWiki.
• Плагины действий могут быть использованы для расширения или изменения многих аспектов основных операци DokuWiki: от сохранения статей до введения новых режимов действия.
• Плагины администрирования могут предоставить функциональность администрирования DokuWiki - эти плагины доступны для суперпользователей и менеджеров через кнопку Admin.
• Вспомогательные плагины могут использоваться для обеспечения функциональности для многих других плагинов, чтобы не реализовывать в этих плагинах снова и снова одни и те же функции.
• Плагины рендеринга позволяют создавать новые режимы экспорта и заменить стандартный для DokuWiki рендерер xhtml.

Plugin Survey 2009 - обзор для разработчиков, в котором рассмотрены все плагины представленные в пространстве имен plugin сайта www.dokuwiki.org. Данные были собраны 2009-08-13 автоматическим скриптом с небольшой ручной правкой и обработкой. Было проверено 562 статей сожержащий 539 плагинов. Исходные коды 456 плагинов (85%) были загружены и проанализированы.