Vous pouvez positionner la table des matières (TOC) n'importe où sur votre page web. Pour cela installez le plugin phpinc puis ensuite créez un fichier php (par exemple toc.php) et mettez à l'intérieur:

<?php tpl_toc()?>

Placer ensuite le fichier toc.php dans le dossier phpincludes sur la racine de votre site. Voilà, désormais vous pouvez mettre TOC où vous le souhaitez, via un <phpinc=toc.php> comme c'est expliqué sur la page de plugin phpinc.

P.S Pensez à supprimer la ligne <?php tpl_toc()?> dans main.php de votre template ainsi que mettre valeur false à <?php tpl_content()?> (<?php tpl_content(false)?>)