Le logo de DokuWiki fut trouvé lors d'un Concours de Logo et fut créé par Esther Brunner.
Le logo représente différents aspects de DokuWiki. Les stylos multicolores représentent plusieurs utilisateurs entrain d'éditer les mêmes pages. Les pages sont liées simplement (symbolisé par les flèches).
Le logo est licencié sous la licence GPL comme pour le reste de DokuWiki.